プレイヤーに転送された音楽データを再生中にノイズが入る場合、プレイヤーが再生対応していない音楽データを転送されていることが考えられます。
WMA形式の音楽データは128kbpsまでの再生対応となっており、320kbpsなど128kbpsより高いビットレートのWMA形式の音楽データを再生した場合、ノイズが入ってしまいます。
Windows Media Playerの録音データのビットレート設定を御確認頂き、128kbpsを超える設定となっている場合、128kbpsに設定変更をおこない改めてCDの録音、プレイヤーへの転送を行ってください。
Windows Media Player10の設定変更方法Windows Media Player9の設定変更方法